昆明轨道交通有限公司标志不仅是作为企业标志，同时也将应用到昆明轨道交通出入站口指示性标牌、轨道列车车身、与轨道交通有关的各种公益性宣传资料等公共设施中。标志设计思路集中体现了昆明轨道交通有限公司 “开拓创新、团结拼搏、扎实廉洁、优质高效” 的企业精神、性质及用途。具体有以下几点：

1.标志从形状上提取“昆明（Kunming）”汉语拼音中的首字母“K”为主体元素，并且也形似字母“R”，英文“Rail（轨道）”的首字母，旨在突出昆明的城市轨道交通。

2.与主体元素“轨道”相连接的是由一片“树叶”演化而来的吉祥图案，色彩上运用嫩绿色，形成了植物的 “幼苗”。突出四季如春、气候宜人的昆明，就像植物的幼苗时刻迸发出新的生命活力与光彩。

3.整个图案造型精炼美观且具有国际化形象，暗喻了轨道交通的建设与发展是昆明城市建设发展史中的大手笔。

4.方案色彩同时运用嫩绿色和蓝色，其中蓝色的列车车头截面运用到“K”的笔画中，用艺术化处理体现出速度感。蓝色同时可让人联想到昆明标志之一“滇池”及春城蔚蓝的天空之色。整体色彩在绿色环保的基础上加入了现代科技成分，造型更精致简洁，具有国际化特点，为昆明打造区域国际化城市添一笔亮色。