南京农业大学90周年校庆徽标设计以“90”字样如当空舞动的彩练，具流畅和上扬的动感，表达欢庆90华诞的喜悦，同时寓意我校柔韧与自信的拼搏精神。“90”又抽象为我校90年的发展道路是曲折前进。“0”字又似凤形，寓意90年来学校俊彦云集，群贤毕至。