为提升福建省教育考试院品牌形象，增强干部职工的集体凝聚力，2012年4月下旬福建省教育考试院启动院标设计工作，十三套设计方案经征求全院干部职工意见，形成两套预选方案，经院长办公会议遴选确定正式方案，并于2012年9月20日起正式启用。

标志主体由“福建省教育考试院”英文名称的缩写字母“FJEEA”组合演变为篆书的“闽”字，重心部分由书籍、试卷、笔等有关教育考试的典型符号构成，外圆内方的结构蕴含着“公平公正”的理念，整体形成了“鱼跃龙门”的意象，概念化地呈现了福建省教育考试院的名称，以及教育招生考试工作的特点，充分体现了福建省“海滨邹鲁，文儒之乡”的地域特色和文化气息。