大连医科大学标志主体图案为校门与蛇杖纹样。校门图形来源于1948年五四路26号学校楼门，与1947年柳林街98号主楼大门设计一脉相承，也是新校园“四七门”的形象来源，代表了大连医科大学悠久的历史与绵延不息的文化传承。

蛇杖代表医学，将其放置在门形图案中，共同诠释“医学之门”的含义。莘莘学子由此门步入医学殿堂，勤勉治学；待学有所成，再经此门步入社会，悬壶济世。

大连医科大学标志采用拱形门与蛇杖二者构成“M”形状，为英文“Medical（医学的）”一词的首字母，从形式上强化了“医学之门”的概念。