盘龙城遗址博物馆标志将“龙”的元素过于表现化，盘龙城最早叫盘土城，是老地名；发现城址后，因地处盘龙湖的湖畔，因而得名，采用龙的元素而没能将龙巧妙的应用，对于盘龙城遗址保护区及其宫殿并没有紧紧扣住，博物馆的建设及标志都是为了突出这个遗址保护区。