阿里山森林铁路标志设计采用代表高山与森林之“绿色”为标志背景颜色，传达阿里山铁路为森林铁路，也是登山与高山铁路；另绿色又蕴含有长青不朽之意义，以绿色象征阿里山森林铁路动态保存，永续经营的理念。

(一)为发展铁道观光，以现今最代表森铁之“红色”机关车凸显阿里山森林铁路为大阿里山风景区之观光亮点，并以此展现打造观光铁道之决心，以期达成世界级高山铁道的愿景。

(二)以“圆形”代表阿里山森林铁路运转圆满顺利、行车平安。