吉首大学校徽的主题图形为两只展翅飞翔的凤与凰，表现了“凤飞千仞，薪传八方”的吉大精神，以及招才集贤的办学宗旨。标志为圆形向心式旋转构图，外形趋向于中国传统的“太极图”，象征吉大和谐、团结、浑融的整体状态。